刊名:植物遗传资源学报
曾用名:植物遗传资源科学
主办:中国农业科学院作物科学研究所;中国农学会
主管:中华人民共和国农业部
ISSN:1672-1810
CN:11-4996/S
语言:中文
周期:双月
影响因子:1.434084
被引频次:35739
数据库收录:
中文核心期刊(2017);CA化学文摘(2013);CSCD中国科学引文库(2019-2020);统计源期刊(2018);期刊分类:农业
2.3 植物线粒体自噬调控机制
对于植物线粒体自噬的研究,目前大多数集中在拟南芥和简单藻类中[28]。Li 等[12,29]在拟南芥中发现了酵母ATG11 的同系物,并证明其与线粒体自噬相关。拟南芥ATG11 虽然与酵母ATG11、哺乳动物FIP200(分子大小为200 kD 的黏着斑激酶家族相互作用蛋白)同源,但是同源性较低,分别为18%和15%[12]。 拟 南 芥 ATG11 蛋 白 结 构 中 包 含 ATG11/coiled-coil 基序和 ATG7-like 结构域,这 2 个结构分别是这2 个蛋白家族的特异性结构,所以拟南芥ATG11 与 这 2 种 蛋 白 在 功 能 上 具 有 相 似 性[12]。ATG11 蛋白的一个显著特征是能够与其他ATG 组分的多种组合相互作用,这意味着它可以作为主要支架来帮助组装和整合 ATG 系统[30]。
在拟南芥中,ATG11与ATG8、ATG13和ATG101直接相互作用,与ATG1 通过ATG13 间接相互作用[12,29],如图 1 所示。其中,自噬相关 ATG1-ATG13激酶复合物是一种上游调节因子,由Ser/Thr 激酶ATG1(哺乳动物中ULK1/2 的同系物)、其激酶活性调节因子ATG13 和一些起支架和调节作用的辅助蛋白组成,该复合物通过ATG1 和ATG13 磷酸化状态的变化,将代谢和环境信号与自噬小泡联系起来,调控自噬水平[31,32]。在拟南芥中,ATG11是ATG1/13复合物的辅助蛋白,它可以作为支架将复合物与自噬线粒体以及自噬膜连接起来,并促进囊泡向液泡的传递,是自噬小泡形成的必要条件,参与线粒体的选择性自噬[29]。
在受损线粒体中,激活的ATG1/ATG13 复合物与辅助蛋白ATG11、ATG101 通过去磷酸化的方式结合,并被招募到线粒体表面,与线粒体外膜或内膜受体蛋白相互作用,诱导 PAS 的形成[17]。ATG8 通过PE(Phosphatidyl ethanolamine,磷脂酰乙醇胺)的脂化作用修饰自噬泡,形成 ATG8-PE 复合物[33]。ATG8-PE 复合物修饰成熟的自噬体膜是观察植物体中自噬体形成的良好标记[33-35]。ATG11、ATG1 和膜受体样蛋白分别与ATG8-PE 修饰的自噬泡结合,形成自噬体,引发线粒体的传递与降解[12,17]。
图1 线粒体自噬调控机制模型
3 植物中的线粒体自噬受体
在线粒体自噬的研究中,线粒体表面的特定蛋白质作为受体,招募自噬相关组分到线粒体,并与之相互作用,诱发线粒体自噬的发生。哺乳动物线粒体表面中的PINK1、FUNDC1 以及酵母线粒体表面的ATG32 都是自噬线粒体的OMM 受体,在自噬中作为降解标记。但是到目前为止,在植物中还没有发现有蛋白质有类似功能。由于ATG8 是自噬机制的核心蛋白之一,Xie 等[36]开发了一种生物信息学工具hfAIM 来预测可能与ATG8 有相互作用的蛋白,含有与ATG8 相互作用基序的线粒体膜蛋白可能是线粒体受体蛋白,利用这种方法可以寻找植物中的线粒体自噬受体。
在拟南芥中鉴定出的42 种线粒体外膜蛋白中[37],根据预测其中与ATG8 存在相互作用的有12种,包括己糖激酶1(Hexokinase 1),电压依赖性阴离子通道 2(Voltage-Dependent Anion Channel,VDAC2),移位酶TOM20-2、TOM20-3、TOM20-4 以及TOM40等[17]。在哺乳动物细胞中,己糖激酶可以通过抑制TOR 自噬通路来调控自噬水平[38];在哺乳动物的PINK1/Parkin 介导的线粒体自噬途径中,VDAC 是Parkin 泛素化线粒体蛋白的重要靶点[39];移位酶TOM 作为线粒体外膜上的通道蛋白,介导了自噬蛋白如 PINK1 的导入[40,41]。
在OMM 破裂,线粒体内膜(Inner Mitochondrial Membrane,OMM)暴露出来的情况下,IMM 蛋白也会作为受体参与线粒体自噬。在拟南芥已经鉴定出的213 种 IMM 蛋白中[42,43],预测与 ATG8 有相互作用的蛋白质有36 种[17]。其中的线粒体内膜转位酶(Translocase of Inner Mitochondrial Membrane,TIM)TIM17、TIM23,NADH-泛醌氧化还原酶(NADHUbiquinone Oxidoreductase),ATP 依赖的锌金属蛋白酶(ATP-Dependent Zinc Metalloprotease)FtSH 11、FtSH 4 以及线粒体钙离子单向转运蛋白(Mitochon?drial Calcium Uniporter Protein)MCU1、MCU6 等都发现与线粒体自噬相关[44-47],而这些蛋白质是如何调控线粒体自噬需要进一步探究。
4 植物中的线粒体自噬蛋白酶
蛋白酶是线粒体自噬的重要组分,在线粒体自噬的多种途径中都有蛋白酶的参与。菱形蛋白酶是一类保守的膜内蛋白酶,线粒体中的菱形蛋白酶参与了线粒体形态和功能的调节[48-50]。在植物的叶绿体和线粒体中也存在一些菱形蛋白酶[51,52]。在拟南芥线粒体中鉴定出的菱形蛋白酶AtRBL12,AtRBL12不能介导其他紧密相关的菱形蛋白酶所识别的底物的加工[51]。在拟南芥叶绿体中鉴定出2 种菱形蛋白酶AtRBL8 和AtRBL9,这2 种蛋白酶的单或双突变体中均未观察到剧烈的表型变化[52]。因此,没有证据表明叶绿体或线粒体菱形蛋白酶在植物自噬中起积极作用。
文章来源:《植物遗传资源学报》 网址: http://www.zwyczyxbzz.cn/qikandaodu/2021/0616/708.html
上一篇:植物环核苷酸门控离子通道的研究进展
下一篇:微生物燃料电池的现状与研究